地質中心內有地質公園的介紹，還有澎湖的自然保護區，和貓嶼海鳥保護區、七美石器工廠的分佈圖、澎湖地質年代表、世界各國地質公園、台灣地質公園、石材生活主題、澎湖特色景觀、玄武岩的介紹等等，非常豐富詳細。
內部空間雖然不大，卻分為15區，有：「澎湖玄武岩展示」、「澎湖特色景觀」、「玄武岩介紹」、「澎湖地質年代表」、「澎湖六大地質公園」、「澎湖的自然及海鳥保護區」、「七美史石器工廠」、「世界共同的資產」、「石材生活主題」、「視聽室」、「圖書與石材工藝品」及「互動益智活動」等。
特別的是地質中心的外觀主要是以石為主，走的是傳統與和式的風格，是非常有特色的建築。
內部分成許多館區，裡頭也木製的樓梯，樓中樓層層往上去，可以站在較高的地方欣賞館內。
裡頭也有許多地區是提供給小朋友的科學教學的喔！搖滾藍洞-VR體驗為讓大家一窺澎湖自然秘境之美，澎湖縣政府在澎湖海洋地質公園中心內搭建一座迷你藍洞VR體驗劇院，外裝牆面為擬真之玄武岩,，地面投以藍色柔美燈光，宛若進入神祕的藍洞。
玩家將乘坐動感座椅，戴上VR眼鏡，透過360度廣角攝影隨風飛翔，體驗澎湖地質景觀之美，完成一趟現實生活中無法達成的冒險之旅。
迷你藍洞VR體驗劇院目前提供兩部影片予遊客體驗，分別是「俯瞰澎湖360」空拍片，以及「澎湖海底360」水下攝影影片，前來體驗的遊客可以依照自己的喜好，選擇自己想體驗的片型。
體驗地點：澎湖海洋地質公園中心(馬公市新明路71號)開放體驗時間：週一至週日上午9:00-12:00 下午14:00-17:00洽詢電話：06-9269737 / 06-9269117※為維護體驗品質，使用本設備全面採網路實聯預約制，請在工作人員引導下使用本設備。
※入場前請配合測量體溫並配戴口罩入場，體溫超過37.5度者將禁止入場使用設備，謝謝您的配合。
※本設備一次為兩人使用，如您未於預約時段準時抵達現場，請配合工作人員指示於預約空閒時段遞補使用體驗設備。
藉由空中俯瞰的視角更能一覽澎湖群島玄武岩地形的獨特且又美不勝收的天然景觀。
片中介紹許多著名的澎湖玄武岩地形景點，如:南方四島西吉嶼的藍洞(又俗稱灶籠)、七美的雙心石滬與小台灣、擁有海上黃石公園美譽的桶盤嶼、奎壁山與赤嶼間的摩西分海、吉貝最美麗的沙尾沙灘、小門嶼的鯨魚洞、以及生長在海底大陸棚的珊瑚礁生態群-秘境森林，總片長約3分半鐘，美景目不暇給，讓人想立即親往一探究竟。
看見澎湖玄武岩地形的美，讓人對這個玄武岩故鄉的澎湖群島印象更深刻，也更懂得欣賞與喜愛。
【澎湖海底360】 「澎湖海底360」水下影片，是特別邀請到拍攝國內水下攝影電影「東經北緯」聞名的袁緒虎導演親身掌鏡入海拍攝。
此片採用360度攝影技術及4K水下攝影技術拍攝而成，是部全景取鏡於澎湖群島海底奇景的影片，影片長度為2分30秒，攝錄了澎湖群島知名的水下景點，綜有海底郵筒、鎖港、珊瑚花園、西吉城堡、薰衣草森林、東吉之廊、梭魚群、東西吉海底廊道等。
全片除了引領觀眾重溫電影「東經北緯」的海底電影場景，同時也讓觀眾觀賞到其他更多繽紛多彩的海底景象。
此外，有鑑於袁緒虎導演對海洋生態的關心，本片也冀望在展示水下豐富生態以及美麗海洋景觀的同時，喚起觀眾對海洋環境的注意以及重視。
【建議停留時間】 2小時
